課程信息

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可分享的證書
完成後獲得證書
100% 在線
立即開始,按照自己的計劃學習。
第 6 門課程(共 8 門)
可靈活調整截止日期
根據您的日程表重置截止日期。
完成時間大約為8 小時
英語(English)
字幕:英語(English)

您將獲得的技能

BioinformaticsBioconductorGenomicsR Programming
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提供方

约翰霍普金斯大学 徽標

约翰霍普金斯大学

教學大綱 - 您將從這門課程中學到什麼

1

1

完成時間為 3 小時

Week One

完成時間為 3 小時
16 個視頻 (總計 126 分鐘), 3 個閱讀材料, 1 個測驗
16 個視頻
Installing R on A Mac 2分鐘
Installing R Studio on a Mac 1分鐘
What is Bioconductor7分鐘
Installing Bioconductor3分鐘
The Bioconductor Website9分鐘
Useful Online Resources5分鐘
R Base Types18分鐘
GRanges - Overview4分鐘
IRanges - Basic Usage12分鐘
GenomicRanges - GRanges8分鐘
GenomicRanges - Basic GRanges Usage8分鐘
GenomicRanges - seqinfo6分鐘
AnnotationHub8分鐘
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 112分鐘
Usecase: AnnotationHub and GRanges, part 213分鐘
3 個閱讀材料
Welcome10分鐘
Syllabus10分鐘
Pre Course Survey10分鐘
1 個練習
Quiz 120分鐘
2

2

完成時間為 2 小時

Week Two

完成時間為 2 小時
8 個視頻 (總計 81 分鐘)
8 個視頻
Biostrings7分鐘
BSgenome6分鐘
Biostrings - Matching6分鐘
BSgenome - Views9分鐘
GenomicRanges - Rle12分鐘
GenomicRanges - Lists6分鐘
GenomicFeatures18分鐘
rtracklayer - Data Import14分鐘
1 個練習
Quiz 220分鐘
3

3

完成時間為 2 小時

Week Three

完成時間為 2 小時
9 個視頻 (總計 79 分鐘)
9 個視頻
Annotation Overview4分鐘
ExpressionSet Overview4分鐘
ExpressionSet9分鐘
SummarizedExperiment7分鐘
GEOquery6分鐘
biomaRt13分鐘
R S4 Classes16分鐘
R S4 Methods10分鐘
1 個練習
Quiz 320分鐘
4

4

完成時間為 2 小時

Week Four

完成時間為 2 小時
7 個視頻 (總計 81 分鐘), 1 個閱讀材料, 1 個測驗
7 個視頻
Short Read4分鐘
Rsamtools12分鐘
oligo14分鐘
limma16分鐘
minfi11分鐘
Count-based RNA-seq analysis15分鐘
1 個閱讀材料
Post Course Survey10分鐘
1 個練習
Quiz 420分鐘

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關於 基因组数据科学 專項課程

With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome. This Specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, along with a variety of software implementation tools like Python, R, Bioconductor, and Galaxy. This Specialization is designed to serve as both a standalone introduction to genomic data science or as a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics, for scientists in these fields seeking to gain familiarity in data science and statistical tools to better interact with the data in their everyday work. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit. Please note that you will not receive a Certificate of Completion if you choose to Audit....
基因组数据科学

常見問題

  • Access to lectures and assignments depends on your type of enrollment. If you take a course in audit mode, you will be able to see most course materials for free. To access graded assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience, during or after your audit. If you don't see the audit option:

    • The course may not offer an audit option. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid.
    • The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.
  • 您注册课程后,将有权访问专项课程中的所有课程,并且会在完成课程后获得证书。您的电子课程证书将添加到您的成就页中,您可以通过该页打印您的课程证书或将其添加到您的领英档案中。如果您只想阅读和查看课程内容,可以免费旁听课程。

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