課程信息

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學生職業成果

50%

完成這些課程後已開始新的職業生涯

43%

通過此課程獲得實實在在的工作福利

20%

加薪或升職
可分享的證書
完成後獲得證書
100% 在線
立即開始,按照自己的計劃學習。
第 5 門課程(共 8 門)
可靈活調整截止日期
根據您的日程表重置截止日期。
完成時間大約為12 小時
英語(English)

您將獲得的技能

BioinformaticsSamtoolsUnixCommand-Line Interface

學生職業成果

50%

完成這些課程後已開始新的職業生涯

43%

通過此課程獲得實實在在的工作福利

20%

加薪或升職
可分享的證書
完成後獲得證書
100% 在線
立即開始,按照自己的計劃學習。
第 5 門課程(共 8 門)
可靈活調整截止日期
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完成時間大約為12 小時
英語(English)

提供方

Placeholder

约翰霍普金斯大学

教學大綱 - 您將從這門課程中學到什麼

內容評分Thumbs Up88%(1,792 個評分)Info
1

1

完成時間為 4 小時

Basic Unix Commands

完成時間為 4 小時
12 個視頻 (總計 105 分鐘), 5 個閱讀材料, 2 個測驗
12 個視頻
Basic Unix Commands 2: Files, Directories, Paths7分鐘
Basic Unix Commands 3: File Naming4分鐘
Basic Unix Commands 4: Content Creation9分鐘
Basic Unix Commands 5: Accessing Content I6分鐘
Basic Unix Commands 6: Accessing Content II4分鐘
Basic Unix Commands 7: Redirecting Content6分鐘
Basic Unix Commands 8: Querying Content15分鐘
Basic Unix Commands 9: Comparing Content11分鐘
Basic Unix Commands 10: Archiving Content13分鐘
Basic Unix Commands 11: Practical Exercises I13分鐘
Basic Unix Commands 12: Practical Exercises II9分鐘
5 個閱讀材料
Welcome Message10分鐘
Syllabus10分鐘
VMBox Download & Instructions10分鐘
Pre-Course Survey10分鐘
Module 1 Exam Instructions **IMPORTANT**10分鐘
2 個練習
Module 1 Quiz30分鐘
Module 1 Exam30分鐘
2

2

完成時間為 3 小時

Week Two

完成時間為 3 小時
11 個視頻 (總計 127 分鐘), 1 個閱讀材料, 2 個測驗
11 個視頻
Sequences and Genomic Features 2: Sequence Representation and Generation11分鐘
Sequences and Genomic Features 3: Annotation14分鐘
Sequences and Genomic Features 4.1: Alignment I13分鐘
Sequences and Genomic Features 4.2: Alignment II9分鐘
Sequences and Genomic Features 5: Recreating Sequences & Features12分鐘
Sequences and Genomic Features 6: Genomic Feature Retrieval5分鐘
Sequences and Genomic Features 7: SAMtools I11分鐘
Sequences and Genomic Features 8: SAMtools II9分鐘
Sequences and Genomic Features 9: BEDtools I15分鐘
Sequences and Genomic Features 10: BEDtools II15分鐘
1 個閱讀材料
Module 2 Exam Instructions **IMPORTANT**10分鐘
2 個練習
Module 2 Quiz30分鐘
Module 2 Exam30分鐘
3

3

完成時間為 2 小時

Week Three

完成時間為 2 小時
8 個視頻 (總計 55 分鐘), 1 個閱讀材料, 2 個測驗
8 個視頻
Alignment & Sequence Variation 2: Alignment & Variant Detection Tools5分鐘
Alignment & Sequence Variation 3: VCF11分鐘
Alignment & Sequence Variation 4: Bowtie9分鐘
Alignment & Sequence Variation 5: BWA 4分鐘
Alignment & Sequence Variation 6: SAMtools (mpileup)6分鐘
Alignment & Sequence Variation 7: BCFtools8分鐘
Alignment & Sequence Variation 8: Variant Calling5分鐘
1 個閱讀材料
Module 3 Exam Instructions **IMPORTANT**10分鐘
2 個練習
Module 3 Quiz30分鐘
Module 3 Exam30分鐘
4

4

完成時間為 3 小時

Week Four

完成時間為 3 小時
8 個視頻 (總計 75 分鐘), 2 個閱讀材料, 2 個測驗
8 個視頻
Tools for Transcriptomics 2: RNA-seq7分鐘
Tools for Transcriptomics 3.1: Tophat I9分鐘
Tools for Transcriptomics 3.2: Tophat II 8分鐘
Tools for Transcriptomics 4: Cufflinks10分鐘
Tools for Transcriptomics 5: Cuffdiff16分鐘
Tools for Transcriptomics 6.1: Integrated Genomics Viewer I8分鐘
Tools for Transcriptomics 6.2: Integrated Genomics Viewer II 6分鐘
2 個閱讀材料
Module 4 Exam Instructions **IMPORTANT**10分鐘
Post-Course Survey10分鐘
2 個練習
Module 4 Quiz30分鐘
Module 4 Exam30分鐘

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