تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية

提供方
Coursera Project Network
在此指導項目中,您將:

فهم أهمية واستخدام المجموعات الهرمية باستخدام ملفات تخصيص الانحراف.

تحدد موقع ملفات الجينوم الفيروسي (cDNA) ومعالجتها لحساب ملفات تعريف الانحراف.

فهم نظرية استخدام معادلة فيثاغورس لحساب المسافة الإقليدية. وتطبيق ذلك باستخدام بايثون لبناء مصفوفة ربط.

Clockساعاتين
Intermediate中級
Cloud無需下載
Video分屏視頻
Comment Dots阿拉伯語(Arabic)
Laptop僅限桌面

بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.

您要培養的技能

  • Python Programming
  • Genomics
  • plotting

分步進行學習

在與您的工作區一起在分屏中播放的視頻中,您的授課教師將指導您完成每個步驟:

  1. الخطوة الأولى: مقدمة (توسيع تحليل الانحراف)

  2. الخطوة الثانية: تحديد موقع ملفات البيانات ومعالجتها

  3. الخطوة الثالثة: استيعاب البيانات. فهم مجموعة البيانات الناتجة والتعامل معها

  4. الخطوة الرابعة: التجميع الهرمي - (المقياس - Metric)

  5. الخطوة الخامسة: التجميع الهرمي - (الترتيب والطرق Ordering & Methods)

  6. الخطوة الساسدسة: رسم المخطط الشجري (dendrogram)

  7. الخطوة السابعة: تحليل المخطط الشجري (dendrogram)

  8. الخطوة الثامنة: أخطاء يجب تجنبها

指導項目工作原理

您的工作空間就是瀏覽器中的雲桌面,無需下載

在分屏視頻中,您的授課教師會為您提供分步指導

常見問題

常見問題

還有其他問題嗎?請訪問 學生幫助中心