課程信息

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This course distills for you expert knowledge and skills mastered by professionals in Health Big Data Science and Bioinformatics. You will learn exciting facts about the human body biology and chemistry, genetics, and medicine that will be intertwined with the science of Big Data and skills to harness the avalanche of data openly available at your fingertips and which we are just starting to make sense of. We’ll investigate the different steps required to master Big Data analytics on real datasets, including Next Generation Sequencing data, in a healthcare and biological context, from preparing data for analysis to completing the analysis, interpreting the results, visualizing them, and sharing the results.
Needless to say, when you master these high-demand skills, you will be well positioned to apply for or move to positions in biomedical data analytics and bioinformatics. No matter what your skill levels are in biomedical or technical areas, you will gain highly valuable new or sharpened skills that will make you stand-out as a professional and want to dive even deeper in biomedical Big Data. It is my hope that this course will spark your interest in the vast possibilities offered by publicly available Big Data to better understand, prevent, and treat diseases.

學生職業成果

50%

完成這些課程後已開始新的職業生涯

43%

通過此課程獲得實實在在的工作福利

20%

加薪或升職

可分享的證書

完成後獲得證書

100% 在線

立即開始，按照自己的計劃學習。

可靈活調整截止日期

根據您的日程表重置截止日期。

高級

完成時間大約為40 小時

英語（English）

字幕：英語（English）, 西班牙語（Spanish）, 俄語（Russian）, 法語（French）

您將獲得的技能

BioinformaticsData Clustering AlgorithmsBig DataR Programming

學生職業成果

50%

完成這些課程後已開始新的職業生涯

43%

通過此課程獲得實實在在的工作福利

20%

加薪或升職

可分享的證書

完成後獲得證書

100% 在線

立即開始，按照自己的計劃學習。

可靈活調整截止日期

根據您的日程表重置截止日期。

高級

完成時間大約為40 小時

英語（English）

字幕：英語（English）, 西班牙語（Spanish）, 俄語（Russian）, 法語（French）

講師

授課教師評分

4.38/5 （20 個評分）

Isabelle Bichindaritz

教學大綱 - 您將從這門課程中學到什麼

內容評分90%（1,675 個評分）

週

1

週 1

完成時間為 4 小時

Genes and Data

After this module, you will be able to

完成時間為 4 小時

11 個視頻（總計 59 分鐘）, 2 個閱讀材料, 6 個測驗

11 個視頻

Introduction to the Course1分鐘

Introduction to Module1分鐘

DNA and Genes9分鐘

RNA and Proteins6分鐘

Transcription Process4分鐘

Transcription Animation1分鐘

Translation Process5分鐘

Translation Animation2分鐘

Data, Variables, and Big Datasets6分鐘

Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9分鐘

Working with cBioPortal - Gene Networks9分鐘

2 個閱讀材料

Module 1 cBioPortal Data Analytics10分鐘

Module 1 Resources10分鐘

6 個練習

DNA, RNA, Genes, and Proteins30分鐘

Transcription and Translation Processes30分鐘

Data, Variables, and Big Datasets30分鐘

Working with cBioPortal30分鐘

Module 1 Quiz30分鐘

Module 1 cBioPortal Data Analytics30分鐘

週

2

週 2

完成時間為 8 小時

Preparing Datasets for Analysis

After this module, you will be able to:

完成時間為 8 小時

13 個視頻（總計 75 分鐘）, 4 個閱讀材料, 8 個測驗

13 個視頻

Introduction to Module4分鐘

Datasets and Files10分鐘

Data Sources11分鐘

Importance of Data Preprocessing4分鐘

Data Preprocessing Tasks2分鐘

Replacing Missing Values3分鐘

Data Normalization9分鐘

Data Discretization5分鐘

Feature Selection3分鐘

Data Sampling2分鐘

Principles of R6分鐘

R Language1分鐘

Jupyter Notebooks 1017分鐘

4 個閱讀材料

Jupyter Notebooks Essentials10分鐘

Notebook Module 2 Tutorial10分鐘

Module 2 R Data Preprocessing10分鐘

Module 2 Resources10分鐘

8 個練習

Datasets and Files30分鐘

Data Preprocessing Tasks30分鐘

Replacing Missing Values30分鐘

Normalization and Discretization30分鐘

Data Reduction30分鐘

Working with R30分鐘

Module 2 Quiz30分鐘

Module 2 R Data Preprocessing30分鐘

週

3

週 3

完成時間為 7 小時

Finding Differentially Expressed Genes

After this module, you will be able to

完成時間為 7 小時

9 個視頻（總計 53 分鐘）, 4 個閱讀材料, 6 個測驗

9 個視頻

Introduction to Module2分鐘

Overview of Feature Selection Methods13分鐘

Filter Methods4分鐘

Wrapper Methods4分鐘

Evaluation Schemes7分鐘

Selecting Differentially Expressed Genes3分鐘

Heatmaps6分鐘

R Scripts for Feature Selection3分鐘

Jupyter Notebooks 1017分鐘

4 個閱讀材料

Notebook Module 3 Tutorial10分鐘

Jupyter Notebooks Essentials10分鐘

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分鐘

Module 3 Resources10分鐘

6 個練習

Feature Selection Methods30分鐘

Evaluation Schemes30分鐘

Differentially Expressed Genes30分鐘

Heatmaps30分鐘

Module 3 Quiz30分鐘

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes30分鐘

週

4

週 4

完成時間為 8 小時

Predicting Diseases from Genes

After this module, you will be able to

完成時間為 8 小時

12 個視頻（總計 85 分鐘）, 4 個閱讀材料, 10 個測驗

12 個視頻

Introduction to Module9

Overview of Classification and Prediction Methods8分鐘

Classification Methods Based on Analogy12分鐘

Classification Methods Based on Rules13分鐘

Classification Methods Based on Neural Networks7分鐘

Classification Methods Based on Statistics3分鐘

Classification Methods Based on Probabilities7分鐘

Prediction Methods4分鐘

Evaluation Schemes13分鐘

Prediction Workflow4分鐘

R Scripts for Prediction1分鐘

Jupyter Notebooks 1017分鐘

4 個閱讀材料

Jupyter Notebooks Essentials10分鐘

Notebook Module 4 Tutorial10分鐘

Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分鐘

Module 4 Resources10分鐘

10 個練習

Overview30分鐘

Classification with Analogy30分鐘

Classification based on Rules30分鐘

Classification with Neural Networks30分鐘

Classification based on Statistics30分鐘

Classification based on Probabilities30分鐘

Prediction Models30分鐘

Evaluation Schemes30分鐘

Module 4 Quiz30分鐘

Module 4 R Predicting Diseases from Genes30分鐘

週

5

週 5

完成時間為 7 小時

Determining Gene Alterations

After this module, you will be able to

1. List different types of gene alterations. 2. Compare and contrast methods for detecting gene mutations. 3. Compare and contrast methods for detecting methylation. 4. Compare and contrast methods for detecting copy number variations. 5. Quantify genomic alterations. 6. Connect genomic alterations to differential expression of genes. 7. Write programs in R for determining gene alterations and their relationship with gene expression.

完成時間為 7 小時

9 個視頻（總計 81 分鐘）, 4 個閱讀材料, 8 個測驗

9 個視頻

Introduction to Module1分鐘

Overview of Gene Alterations16分鐘

Genetic Mutations9分鐘

Finding Genetic Mutations7分鐘

Methylation8分鐘

Copy Number Alterations10分鐘

Genomic Alterations and Gene Expressions16分鐘

R Scripts for Gene Alterations1分鐘

Jupyter Notebooks 1017分鐘

4 個閱讀材料

Notebook Module 5 Tutorial10分鐘

Jupyter Notebooks Essentials10分鐘

Module 5 R Gene Alterations10分鐘

Module 5 Resources10分鐘

8 個練習

Gene Alterations30分鐘

Gene Mutations30分鐘

Methylation30分鐘

Copy Number Alterations30分鐘

Genomic Alterations and Gene Expressions30分鐘

Module 5 Quiz (Temporary)30分鐘

Module 5 Quiz30分鐘

Module 5 R Gene Alterations30分鐘

週

6

週 6

完成時間為 6 小時

Clustering and Pathway Analysis

After this module, you will be able to 1. Find clusters in biomedical data involving genes.2. Analyze and visualize biological pathways. 3. Write R scripts for clustering and for pathway analysis.

完成時間為 6 小時

12 個視頻（總計 73 分鐘）, 5 個閱讀材料, 5 個測驗

12 個視頻

Introduction to Module2分鐘

Overview of Clustering Methods7分鐘

Similarity Assessment8分鐘

Clustering with KMeans7分鐘

Density Based Clustering4分鐘

Hierarchical Clustering6分鐘

Pathway Analysis12分鐘

Pathway Discovery7分鐘

Pathway Visualization6分鐘

R Scripts for Clustering and Pathway Analysis1分鐘

Jupyter Notebooks 1017分鐘

Concluding Remarks1分鐘

5 個閱讀材料

Jupyter Notebooks Essentials10分鐘

Notebook Module 6 Tutorial10分鐘

Module 6 R Clustering and Pathways10分鐘

Module 6 Resources10分鐘

Acknowledgements10分鐘

5 個練習

Clustering30分鐘

Clustering Methods30分鐘

Pathways30分鐘

Module 6 Quiz30分鐘

Module 6 R Clustering and Pathways30分鐘

常見問題

我什么时候能够访问课程视频和作业？
讲座和作业的访问权限取决于您的注册类型。如果您以旁听模式参加课程，则可以免费查看大多数课程资料。要访问评分作业并获得证书，您需要在旁听期间或之后购买证书体验。如果看不到旁听选项：
课程可能不提供旁听选项。您可以尝试免费试用，也可以申请助学金。
课程可能会改为提供'完整课程，没有证书'。通过此选项，您可以查看所有课程材料、提交所要求的作业，以及获得最终成绩。这也意味着您将无法购买证书体验。
我购买证书后会得到什么？
您购买证书后，将有权访问所有课程材料，包括评分作业。完成课程后，您的电子课程证书将添加到您的成就页中，您可以通过该页打印您的课程证书或将其添加到您的领英档案中。如果您只想阅读和查看课程内容，可以免费旁听课程。
Is financial aid available?
是的，Coursera 可以向无法承担学费的学生提供助学金。点击左侧‘注册’按钮下的‘助学金’链接即可申请助学金。您可以根据屏幕提示完成申请，申请获批后会收到通知。了解详情。

還有其他問題嗎？請訪問學生幫助中心。

Big Data, Genes, and Medicine