課程信息
4.2
100 個評分
27 個審閱
100% 在線

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立即開始,按照自己的計劃學習。
可靈活調整截止日期

可靈活調整截止日期

根據您的日程表重置截止日期。
高級

高級

完成時間(小時)

完成時間大約為22 小時

建議:6 weeks of study, 3-5 hours per week...
可選語言

英語(English)

字幕:英語(English)...

您將獲得的技能

BioinformaticsData Clustering AlgorithmsBig DataR Programming
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高級

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教學大綱 - 您將從這門課程中學到什麼

1
完成時間(小時)
完成時間為 2 小時

Genes and Data

After this module, you will be able to 1. Locate and download files for data analysis involving genes and medicine. 2. Open files and preprocess data using R language. 3. Write R scripts to replace missing values, normalize data, discretize data, and sample data. ...
Reading
11 個視頻(共 59 分鐘), 2 個閱讀材料, 6 個測驗
Video11 個視頻
Introduction to Module1分鐘
DNA and Genes9分鐘
RNA and Proteins6分鐘
Transcription Process4分鐘
Transcription Animation1分鐘
Translation Process5分鐘
Translation Animation2分鐘
Data, Variables, and Big Datasets6分鐘
Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9分鐘
Working with cBioPortal - Gene Networks9分鐘
Reading2 個閱讀材料
Module 1 cBioPortal Data Analytics10分鐘
Module 1 Resources10分鐘
Quiz6 個練習
DNA, RNA, Genes, and Proteins4分鐘
Transcription and Translation Processes6分鐘
Data, Variables, and Big Datasets4分鐘
Working with cBioPortal6分鐘
Module 1 Quiz20分鐘
Module 1 cBioPortal Data Analytics8分鐘
2
完成時間(小時)
完成時間為 5 小時

Preparing Datasets for Analysis

After this module, you will be able to: 1. Locate and download files for data analysis involving genes and medicine. 2. Open files and preprocess data using R language. 3. Write R scripts to replace missing values, normalize data, discretize data, and sample data. ...
Reading
13 個視頻(共 75 分鐘), 4 個閱讀材料, 8 個測驗
Video13 個視頻
Datasets and Files10分鐘
Data Sources11分鐘
Importance of Data Preprocessing4分鐘
Data Preprocessing Tasks2分鐘
Replacing Missing Values3分鐘
Data Normalization9分鐘
Data Discretization5分鐘
Feature Selection3分鐘
Data Sampling2分鐘
Principles of R6分鐘
R Language1分鐘
Jupyter Notebooks 1017分鐘
Reading4 個閱讀材料
Jupyter Notebooks Essentials10分鐘
Notebook Module 2 Tutorial10分鐘
Module 2 R Data Preprocessing10分鐘
Module 2 Resources10分鐘
Quiz8 個練習
Datasets and Files4分鐘
Data Preprocessing Tasks4分鐘
Replacing Missing Values2分鐘
Normalization and Discretization4分鐘
Data Reduction4分鐘
Working with R4分鐘
Module 2 Quiz20分鐘
Module 2 R Data Preprocessing10分鐘
3
完成時間(小時)
完成時間為 4 小時

Finding Differentially Expressed Genes

After this module, you will be able to 1. Select features from highly dimensional datasets. 2. Evaluate the performance of feature selection methods. 3. Write R scripts to select features from datasets involving gene expressions. ...
Reading
9 個視頻(共 53 分鐘), 4 個閱讀材料, 6 個測驗
Video9 個視頻
Overview of Feature Selection Methods13分鐘
Filter Methods4分鐘
Wrapper Methods4分鐘
Evaluation Schemes7分鐘
Selecting Differentially Expressed Genes3分鐘
Heatmaps6分鐘
R Scripts for Feature Selection3分鐘
Jupyter Notebooks 1017分鐘
Reading4 個閱讀材料
Notebook Module 3 Tutorial10分鐘
Jupyter Notebooks Essentials10分鐘
Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分鐘
Module 3 Resources10分鐘
Quiz6 個練習
Feature Selection Methods4分鐘
Evaluation Schemes2分鐘
Differentially Expressed Genes4分鐘
Heatmaps4分鐘
Module 3 Quiz16分鐘
Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10分鐘
4
完成時間(小時)
完成時間為 4 小時

Predicting Diseases from Genes

After this module, you will be able to 1. Build classification and prediction models. 2. Evaluate the performance of classification and prediction methods. 3. Write R scripts to classify and predict diseases from gene expressions....
Reading
12 個視頻(共 85 分鐘), 4 個閱讀材料, 10 個測驗
Video12 個視頻
Overview of Classification and Prediction Methods8分鐘
Classification Methods Based on Analogy12分鐘
Classification Methods Based on Rules13分鐘
Classification Methods Based on Neural Networks7分鐘
Classification Methods Based on Statistics3分鐘
Classification Methods Based on Probabilities7分鐘
Prediction Methods4分鐘
Evaluation Schemes13分鐘
Prediction Workflow4分鐘
R Scripts for Prediction1分鐘
Jupyter Notebooks 1017分鐘
Reading4 個閱讀材料
Jupyter Notebooks Essentials10分鐘
Notebook Module 4 Tutorial10分鐘
Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分鐘
Module 4 Resources10分鐘
Quiz10 個練習
Overview4分鐘
Classification with Analogy2分鐘
Classification based on Rules2分鐘
Classification with Neural Networks2分鐘
Classification based on Statistics2分鐘
Classification based on Probabilities2分鐘
Prediction Models2分鐘
Evaluation Schemes2分鐘
Module 4 Quiz20分鐘
Module 4 R Predicting Diseases from Genes10分鐘

講師

Avatar

Isabelle Bichindaritz

Associate Professor
Computer Science

關於 The State University of New York

The State University of New York, with 64 unique institutions, is the largest comprehensive system of higher education in the United States. Educating nearly 468,000 students in more than 7,500 degree and certificate programs both on campus and online, SUNY has nearly 3 million alumni around the globe....

常見問題

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