課程信息
3.7
415 個評分
122 個審閱
專項課程

第 2 門課程(共 8 門)

100% 在線

100% 在線

立即開始,按照自己的計劃學習。
可靈活調整截止日期

可靈活調整截止日期

根據您的日程表重置截止日期。
完成時間(小時)

完成時間大約為11 小時

建議:3 hours/week...
可選語言

英語(English)

字幕:英語(English)

您將獲得的技能

BioinformaticsData AnalysisGenomeGenomics
專項課程

第 2 門課程(共 8 門)

100% 在線

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立即開始,按照自己的計劃學習。
可靈活調整截止日期

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完成時間大約為11 小時

建議:3 hours/week...
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英語(English)

字幕:英語(English)

教學大綱 - 您將從這門課程中學到什麼

1
完成時間(小時)
完成時間為 1 小時

Introduction

This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it....
Reading
2 個視頻 (總計 13 分鐘), 4 個閱讀材料, 1 個測驗
Video2 個視頻
Introduction to the Galaxy Platform5分鐘
Reading4 個閱讀材料
Welcome10分鐘
Syllabus10分鐘
Pre-Course Survey10分鐘
A Note about AWS10分鐘
Quiz1 個練習
Module 1 Quiz22分鐘
2
完成時間(小時)
完成時間為 2 小時

Galaxy 101

In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis. ...
Reading
3 個視頻 (總計 42 分鐘), 1 個測驗
Video3 個視頻
Galaxy 101: Workflows12分鐘
Annotation, Sharing, and Publishing13分鐘
Quiz1 個練習
Module 2 Quiz56分鐘
3
完成時間(小時)
完成時間為 1 小時

Working with sequence data

In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS....
Reading
2 個視頻 (總計 25 分鐘), 1 個測驗
Video2 個視頻
ChIP-Sequence Analysis with MACS14分鐘
Quiz1 個練習
Module 3 Quiz18分鐘
4
完成時間(小時)
完成時間為 4 小時

RNA-seq & Running your own Galaxy

In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy....
Reading
4 個視頻 (總計 49 分鐘), 2 個閱讀材料, 3 個測驗
Video4 個視頻
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12分鐘
Installing Galaxy Locally8分鐘
Galaxy on the Cloud19分鐘
Reading2 個閱讀材料
TopHat availability10分鐘
Post-Course Survey10分鐘
Quiz2 個練習
Module 4 Quiz22分鐘
Module 5 Quiz20分鐘
3.7
122 個審閱Chevron Right
職業方向

50%

完成這些課程後已開始新的職業生涯
工作福利

33%

通過此課程獲得實實在在的工作福利

熱門審閱

創建者 GKSep 6th 2018

This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.

創建者 BGFeb 3rd 2018

Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.

講師

Avatar

James Taylor, PhD

Associate Professor of Biology and Computer Science

關於 约翰霍普金斯大学

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

關於 基因组数据科学 專項課程

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
基因组数据科学

常見問題

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